Publicação de artigos
Em 2013, o Programa publicou 74 artigos em periódicos indexados, sendo que 9 (12,2%) artigos foram no estrato A1, 13 (17,6%) artigos foram no estrato A2, 13 (17,6%) artigos foram no estrato B1, 18 (24,3%) artigos foram no estrato B2, 3 (4,1%) artigos foram no estrato B3, 12 (16,2%) artigos foram no estrato B4 e 6 (8,1%) artigos foram nos estrato B5. A soma de publicações em periódicos A1, A2 e B1 foi de 35,1% do total. Em 2014, o programa publicou 96 artigos em periódicos indexados, sendo que 4 (4,17%) artigos foram no estrato A1, 22 (22,92%) artigos no estrato A2, 34 (35,42%) artigos no estrato B1, 16 (16,67%) artigos no estrato B2, 4 (4,17%) artigos no estrato B3, 12 (12,5%) artigos no estrato B4 e 4 (4,17%) artigos nos estrato B5. A soma de publicações em periódicos A1, A2 e B1 foi de 58,3% do total. Houve uma melhora na quantidade e na qualidade das publicações docentes do ano de 2013 para o ano de 2014. A pontuação média dos professores do programa também aumentou de 2013 para 2014. Em 2013, a pontuação média foi de 165,91 para 230 em 2014. Outro fator positivo apresentado pelo PPGDT foi a variedade de periódicos nos quais os artigos foram publicados. Em 2013 foram publicados artigos em 33 diferentes periódicos, enquanto em 2014 foram publicados artigos em 50 diferentes periódicos.
Participação em palestras e congressos
O corpo docente do PPGDT têm participado ativamente como congressistas, palestrantes e organizadores de eventos científicos em encontros científicos regionais, nacionais e internacionais, com destaque às participações dos membros nas reuniões da FeSBE, Association Research for Vision and Ophthalmology Meeting, Reunião da Sociedade Brasileira de Doenças Tropicais, Congresso Internacional de Medicina Tropical e Malária, Congresso Médico Amazônico e Annual Congress of the European Society of Mycobacteriology (ESM), International Congress for Tropical Medicine and Malaria e Meeting of the Brazilian Society of Immunology (SBI). Além disso, os membros do PPGDT têm participado como revisores de conceituados periódicos internacionais.
Cada vez tem sido mais comum a associação de pesquisadores do Programa com pesquisadores de outros países com destaque às colaborações com os professores Jan Kremers (Alemanha), Reza Nassiri (Estados Unidos da América), Beatriz Odonell (Argentina), Barry Lee (Estados Unidos da América), Bárbara Finlay (Estados Unidos da América), Uriel Kriton (Estados Unidos da América) e David Mirelman (Israel).